Entre ces deux périodes, bien que les travaux continuent, la circulation sera rétablie sous alternat réglementé par des feux. La réouverture complète à la circulation est prévue pour mi-juillet.
Pendant les phases de fermeture complète de la RD 461, des déviations seront mises en place dans les conditions suivantes :
- Les véhicules légers emprunteront la RD 242 (« raccourci de Fuans »).
- Les poids lourds emprunteront également la RD 242 dans le sens Fuans-Morteau mais suivront les RD 329A et 311 par les Fournets dans le sens Morteau-Fuans.