De nombreux militants francs-comtois, y compris Marie-Guite Dufay, présidente de la Région, ont fait savoir qu’ils ne valideront pas la liste couvrant cinq régions mais sans Franc-Comtois positionné avant la 9ème place.
Deux candidats bourguignons, dont un député européen sortant, ont d’ailleurs démissionné de la liste qui apparaît plus comme une liste de courants que de régions.