Il était aux alentours de 16h quand le train corail, en provenance de Lyon et à destination de Strasbourg, est entré en gare de Besançon Viotte. Les personnes sur le quai ont vu arriver un train duquel s'échappait une fumée. Le train s'immobilisa normalement sur le quai C, et plusieurs agents SNCF se sont précipités vers l'avant du train avec des extincteurs. L'incendie maîtrisé assez rapidement n'a pas nécessité l'intervention des pompiers.
Le train qui accusait déjà un retard de 50 minutes devait repartir quelques dizaines de minutes après son arrivée, le temps pour les agents de la SNCF d'enlever la voiture où l'incendie s'était déclenché.