Après consultation et avis de près de 265 prêtres, diacres, religieux et laïcs, l’archevêque de Besançon Mgr Lacrampe a nommé le père Jean-Marie Vuattoux, vicaire général à compter du 1er mars 2009.
Il exercera conjointement sa charge avec l'autre vicaire général, le père Jean-Claude Menoud.