Ferme typique des Hautes Combes du massif jurassien de 1771, c’est une ferme bloc, c'est-à dire où toutes les fonctions sont réunies dans un même volume : habitation, activité agricole et activité artisanales. Elle est construite pour répondre aux contraintes climatiques rigoureuses.
L’intérieur a été reconstitué et meublé tel qu’il était au XVIIIème siècle. Deux expositions sont à voir dans la grange et l’écurie de la ferme des Bouchoux :
- Gérard Benoît à la Guillaume : «A propos des paysages»
- Folklore Comtois : «Les fondateurs du musée et la photographie».