Les rivières concernées sont :
- Le Gland ainsi que les canaux et plans d’eau en dérivation de ce cours d’eau. Les communes concernées sont : Audincourt, Glay, Hérimoncourt, Meslières, Roches-les-Blamont et Seloncourt.
- La Savoureuse sur les communes de Nommay, Sochaux, Vieux Charmont dans le Doubs et Andelnans, Belfort, Bermont, Botans, Chatenois-les-Forges, Danjoutin, Evette-Salbert, Sermamagny, Sévenans, Trévenans et Valdoie dans le Territoire de Belfort.
- Allan et Allaine ainsi que les canaux et plans d’eau en dérivation de ces cours d’eau. Les communes concernées : Allenjoie, Bart, Bavans, Brognard, Courcelles-les-Montbéliard, Etupes, Exincourt, Fesches-le-Chatel, Montbéliard, Sainte-Suzanne, Sochaux, Vieux-Charmont et Voujeaucourt dans le Doubs et Bourogne, Delle, Grandvillars, Joncherey, Meziré, Morvillars et Thiancourt dans le Territoire de Belfort.
- Lizaine ainsi que les plans d’eau alimentés par cette rivière.
La pêche n'est pa interdite, il s'agit d'interdition de consommation et de commercialisation