Depuis mai 2009, Stéphane Fratacci occupait le poste de secrétaire général du ministère de l’immigration. Auparavant, il avait été nommé en 2007 préfet de l'Aisne après un passage au ministère de l'intérieur en qualité de directeur des libertés publiques et des affaires juridiques (2001-2007).
Stéphane Fratacci va succéder à Christian Decharrière qui était en poste depuis décembre 2010.