Plusieurs projets vont pouvoir se réaliser dans la région :
| Autoroute | Nom de l'opération | Région | Coût de construction (en millions d'€ HT) |
| A6 | Demi-diffuseur de Chalon-Champforgeuil | Bourgogne - Franche-Comté | 11,5 |
| A6 / A36 / A40 | Aménagement de la continuité hydraulique de 5 passages inférieurs |
Bourgogne - Franche-Comté Auvergne - Rhône-Alpes | 3,415 |
| A6 / A36 | Restauration de cours d'eau et de milieux humides | Bourgogne Franche-Comté - Auvergne - Rhône Alpes | 0,293 |
| A6 / A31 / A36 / A41 / A42 | Traitement des eaux sur points particuliers | Bourgogne - Franche- Comté Auvergne - Rhône-Alpes | 6,130 |
| Réseau APRR | Réalisation de 1700 places de parking de covoiturage | Ile de France Bourgogne Franche- Comté Auvergne - Rhône- Alpes Grand Est | 10,64 |
Ces travaux seront réalisés dans le cadre du plan d'Investissement autoroutier (PIA) de 2016. Ce dernier s'élève à près de 700 millions d'euros au niveau national.