Vers 13h00, le conducteur de l'ambulance a freiné en arrivant au passage à niveau, mais son véhicule à glissé sur la chaussé mouillée et il s’est légèrement engagé sur ce passage non sécurisé par des barrières.
Le train est venu percuter l'avant de l’ambulance, avant de s'immobiliser une cinquantaine de mètres plus loin. Par chance, aucun patient ne se trouvait à l'intérieur et le conducteur n'a pas été blessé.
Les 15 passagers qui se trouvaient dans le TER reliant Le Locle à Besançon ont été pris en charge par la SNCF et transportés jusqu'à leur destination en bus.