"Ce drapeau est le symbole de l'histoire de la Franche-Comté et de la solidarité qui unit ses habitants" explique dans un communiqué Jean-Pierre Allenbach, président du MFC. "Son décrochage avait été ressenti par les Francs-Comtois comme une humiliation supplémentaire après celles, entres autres, de la perte de leur capitale régionale, de leur propre assemblée et de leur budget." En outre, rien selon lui n'imposait l'enlèvement du drapeau. Il prend en exemple Strasbourg, où le siège du Conseil régional de la nouvelle région "Grand Est" "arbore encore aujourd'hui fièrement les drapeaux historiques des trois régions qui la composent."
Après cette action symbolique, le MFC espère que le Conseil régional, "enfin conscient du côté émotionnel du sujet, ne le retirera pas de sitôt, sauf à démontrer une nouvelle fois sa volonté persistante de renvoyer aux oubliettes de l’histoire le drapeau de la Franche-Comté."