Selon la préfecture, ces mortalités concernent les truites en âge de se reproduire. En ce qui concerne les poissons, le laboratoire d'analyse a conclu à un parasitisme courant pour cette période de l'année, tout en soulignant une anomalie : la présence systématique de vers parasites (nématodes) dans la vessie des poissons analysés.
Cette nouvelle alerte renvoie cependant à la situation générale du Doubs Franco-Suisse, dont le fonctionnement naturel semble pouvoir être altéré par la gestion des ouvrages d'hydro-électricité et des problèmes de qualité chimique de l'eau. L'administration française est à cet égard activement mobilisée pour organiser avec les autorités suisses la création d'une gouvernance Franco-Suisse pour un programme d'actions de fond.
Les résultats de recherche de cyanobactéries ont révélé leur absence dans l'eau brute, mais une présence significative sur les substrats. Selon le laboratoire, cette population est cependant loin d'être majoritaire parmi les nombreuses micro algues présentes. Par ailleurs, l'espèce oscillatoria princeps, suspectée l'an dernier d'être impliquée dans les mortalités piscicoles, n'a pas été identifiée.
La confrontation des données suisses et françaises lors d'une réunion technique franco-suisse (rassemblant les associations de pêche et les services suisses et français) organisée par la Direction Départementale des Territoires le 19 janvier 2011 a conclu à des mortalités saisonnières de la truite fario, suite à la période de reproduction qui affaiblit les poissons, et accentuées par des conditions d'environnement dégradées (cette portion du Doubs n'est pas en bon état général). Ces différents éléments ont conduit les associations de pêche à ne pas suspendre la vente des cartes de pêche.Cette nouvelle alerte renvoie cependant à la situation générale du Doubs Franco-Suisse, dont le fonctionnement naturel semble pouvoir être altéré par la gestion des ouvrages d'hydro-électricité et des problèmes de qualité chimique de l'eau. L'administration française est à cet égard activement mobilisée pour organiser avec les autorités suisses la création d'une gouvernance Franco-Suisse pour un programme d'actions de fond.
En parallèle des démarches franco-suisses, une réunion d'information franco-française impliquant pêcheurs et élus sera organisée très prochainement en sous-préfecture de Montbéliard.