Le tertiaire regroupe les deux tiers des emplois féminins de la région avec en tête les domaines de la santé de l'administration publique et de l'éducation.
Cependant, les postes de cadre et les fonctions de chef d'entreprise sont surtout occupés par les hommes, alors que les femmes sont surreprésentées dans les emplois peu qualifiés. De plus, relève l'INSEE, elles occupent majoritairement des postes à temps partiel (33% contre 5% chez les hommes) avec des horaires atypiques et des salaires faibles.
A l'inverse, les mères de familles monoparentales ont un taux d'activité supérieur à celui des mères en couple (74% contre 53%) et ne sont que 20% à exercer à temps partiel. Les femmes sont plus souvent en situation de précarité que les hommes.
En termes de zones d'emploi, les secteurs frontaliers connaissent un taux d'emploi et d'activité féminin les plus élevés. A l'opposé, le nord-est de la région cumule plusieurs handicaps. Les zones de Montbéliard, Lure-Luxeuil et Belfort ont, non seulement un taux d'activité féminin parmi les plus bas, mais également le taux de chômage le plus élevé.