Ce tirage au sort a été réalisé à Paris le 7 décembre 2015 par Jean-Pierre Papin, Maxime Bossis, Bernard Diomède et Manuel Amoros. Dans le groupe A, le club de Besançon aurait pu affronter l'AS monaco mais c'est sur Angers que le Racing est tombé.
Dans le groupe D, le FC Sochaux-Montbéliard jouera contre Pagny-sur-Moselle (CFA2).
On souhaite déjà la bienvenue au @sco_angers à #Besançon ainsi qu'à tous ses supporters ! #CDF
— Racing Besançon (@RB25_Officiel) 7 Décembre 2015
Groupe A
- FC Annecy (CFA2) - Evian Thonon-Gaillard FC (L2)
- US Raon l’Etape (CFA2) - AS Saint-Etienne (L1)
- Racing Besançon Football (CFA2) - Angers SCO (L1)
- FC Mulhouse (CFA) - Bourg-en-Bresse 01 (L2)
- JS Saint-Jean Beaulieu (DHR) - AS Monaco (L1)
- CS Sedan-Ardennes (Nat) - SC Bastia (L1)
- Entente Sannois Saint-Gratien (CFA) - Toulouse FC (L1)
- FC Villefranche Beaujolais (CFA) - US Sarre Union (CFA)
Groupe B
- Limoges FC (CFA2) - Olympique Lyonnais (L1)
- FC Chambly-Thelle (Nat) - Stade de Reims (L1)
- Etoile Fréjus Saint-Raphaël FC (Nat) - Girondins de Bordeaux (L1)
- AS Muret Football (DH) - Trélissac FC (CFA)
- OGC Nice (L1) - Stade Rennais FC (L1)
- Toulouse Rodéo FC (DH) - Stade Montois (CFA)
- AS Moulins (CFA) - Chamois Niortais (L2)
- CS Volvic (DH) - AC Ajaccio (L2)
Groupe C
- SM Caen (L1) - Olympique de Marseille (L1)
- US Concarneau (CFA) - Tour Auvergne Rennes (CFA2)
- FC Lorient (L1) - Tours FC (L2)
- US Avranches MSM (Nat) - US Malo (CFA)
- US Granville (CFA2) - Stade Lavallois (L2)
- Blanc-Mesnil SP FB (DH) - FC Nantes (L1)
- FC Mantois 78 (CFA) - Stade Briochin (CFA2)
- GFC Ajaccio (L1) - US Sainte-Marienne (DH La Réunion)
Groupe D
- ES Wasquehal (CFA) - Paris Saint-Germain FC (L1)
- Sarreguemines FC (CFA2) - Valenciennes FC (L2)
- AC Amiens (CFA) - Lille LOSC (L1)
- USL Dunkerque (Nat) - ESTAC Troyes (L1)
- US Saint-Omer (DH) - US Boulogne-sur-Mer CO (Nat)
- AS Pagny-sur-Moselle (CFA2) - FC Sochaux-Montbéliard (L2)
- US Chantilly (DH) - En Avant Guingamp (L1)
- RC Epernay Champagne (CFA2) - Montpellier-Hérault SC (L1)