Le tirage au sort s'est déroulé mercredi 5 septembre 2018 dans les locaux de la concession Volkswagen Espace 3000 à Besançon Chateaufarine.
Le Racing Besançon (N3) rencontrera Giro le Puix (R3). Le Besançon Football (N3) ira joué à Lievremont (D2). Pontarlier travailleurs turcs D1) recevra Ornans et Morteau-Montlebon (N3) ira jouer à Montmort (R3)