L'automobiliste, une femme âgée de 50 ans, était incarcérée dans son véhicule qui a été trainé sur la voie ferrée sur près de 200 mètres. La victime est décédée suites de ses blessures. Aucun blessé n' a été à déplorer dans le train. Le conducteur et les cinq passagers sont toutefois en état de choc et ont été pris en charge.
Vendredi 21 décembre 2018, le parquet de Besançon a précisé lors d'une conférence de presse qu'il s'agissait probablement d'un geste suicidaire. Selon France Bleu Besançon, la scène de l'accident a en effet été filmée par un riverain. Des images qui prouvent selon Etienne Manteaux qu'il ne s'agit pas d'un accident "fortuit".
Selon la SNCF, le passage à niveau était en état de fonctionnement lors de l'accident.
