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Le collectif SOS Loue et Rivières Comtoises (LRC) a lancé depuis le 6 avril 2020 l'opération "sentinelles de nos rivières" afin de prévenir les atteintes à l'environnement.

Depuis un mois, les curieux se promènent dans le lit totalement asséché du Doubs, entre Arçon et Morteau. La rivière est totalement à sec sur une vingtaine de kilomètres. Aujourd'hui, six villages du Haut-Doubs sont alimentés par des camions citerne. De son côté, le collectif  SOS Loue et Rivières Comtoises s'inquiète des dérives possibles après les premiers travaux menés dans le lit de la rivière pour colmater les failles.

Depuis juin 2018, la halte fluviale du Moulin Saint-Paul a rouvert suite à des travaux de rénovation. Depuis, Bisontins comme plaisanciers étrangers se permettent quelques heures ou jours de détente sur le bord du Doubs, en plein centre de Besançon. Le responsable du site dresse un premier bilan de la saison, à l'aube de ce mois d'août…

Les pompiers de Clerval,  Baume-les-Dames, Besançon Centre et Montbéliard sont intervenus samedi 2 juin 2018 en fin de journée pour venir en aide à des plaisanciers en difficultés sur le Doubs. 

Les bassins Rhône-Méditerranée et Corse comptent désormais 76 "Rivières en bon état", label décerné par l’agence de l’eau depuis 2015. Cette année, 12 nouvelles rivières reçoivent cette distinction écologique dont une en Bourgogne-Franche-Comté : Les Hautes Tille, en Côte d’Or.

L'Ognon en aval de la Linotte, le Doubs, la Savoureuse, l'Allan et l'Ognon en amont de la Linotte avait été placés en vigilance jaune aux crues dimanche 21 janvier 2018. Ce lundi, la Loue a été placée en alerte Rouge. L'Ognon en amont de la Linotte et le Doubs restent en vigilance Orange.