"Cette décision conforte la stratégie d’équilibre qui a prévalu lors de la répartition des services de l’État et de la Région décidée avant la fusion" explique la présidente de région dans un communiqué alors que le maire de Dijon François Rebsamen a parlé d'une "erreur" et d'un "choix incompréhensible".
Pour Marie-Guite Dufay, Besançon est "confortée" dans son rôle de pôle éducatif regroupant les sièges de la Communauté d'universités et établissements (COMUE), du Rectorat académique et du Crous.