Gare aux pollens d'ambroisie où le risque d'allergie reste élevé, notamment dans les départements de la Nièvre et de la Saône et Loire. Pour les autres territoires de la région, le risque est moyen. Les pollens de graminées, de plantains et d'urticacées restent présents mais en quantité limitée.

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En Bourgogne-Franche-Comté, les pollens sont surveillés sur six sites (Besançon, Dijon, Montbéliard, Auxerre, Nevers et Chalon-sur-Saône). Le Risque allergique lié à l'exposition aux pollens (RAEP) est obtenu à la suite des comptages des grains de pollens prélevés, combinés aux observations du Réseau National de Surveillance Aérobiologique (RNSA). Basé sur une échelle de 0 (nul) à 3 (élevé), cet indice caractérise de manière simple et globale le risque encouru par les personnes allergiques et leur permet de prendre les dispositions nécessaires.