Développement économique: étude d'identification des complémarités économiques sur le périmètre de l'Arc jurassien en vue d'aboutir, entre autres, à des projets de "bi-localisation" d'entreprises.
Transports: élaboration d'un schéma intermodal et durable des transports.
Emploi: renforcer les collaborations des services de l'emploi francs-comtois et suisses en vue d emieux gérer le libre accès au marché de l'emploi.
Développement touristique: autour de la présence de Le Corbusier dans l'Arc jurassien et de la valorisation du patrimoine horloger transjurassien.
Par ailleurs, deux groupes de travail seront créés dans le cadre de la conférence transjurassienne, l'un sur le développmeent durable, l'autre sur l'aménagement du territoire.