La décision de répartition des territoires entre les différents niveaux d’alerte s’appuie sur l’appréciation du profil épidémiologique de chaque territoire suite à l’analyse de 3 indicateurs produits par Santé publique France :
- Le taux d’incidence : le nombre de nouveaux cas pour 100 000 habitants sur 7 jours glissants.
- Le taux d’incidence chez les personnes âgées : le nombre de cas pour 100 000 habitants chez les plus de 65 ans, sur 7 jours glissants.
- La part des patients COVID dans les réanimations : le nombre de patients COVID+ sur le nombre total de lits occupés en réanimation.
Depuis le 23 septembre, le département du Doubs est en zone rose ou rouge pâle, c'est-à-dire en zone d'alerte. En septembre, on comptait 70 cas positifs pour 100.000 habitants alors qu'en août, on comptait 5 cas pour 100.000 habitants. En comparaison, le département des Bouches-du-Rhône est en zone rouge grenat, soit en zone d'alerte maximale. Cela signifie que la circulation du virus est très intense, avec plus de 30 % des lits de réanimation dans les hôpitaux occupés par des patients atteints de Covid.