Le risque allergique est très élevé, il atteint le niveau 4 selon le réseau de surveillance atmosphérique ATMO Franche-Comté. Ces capteurs polliniques sont installés avenue Elisée Cusenier à Besançon et permettent d’obtenir des données sur la qualité de l’air. Même si certains se réjouissent du beau temps c’est ce dernier qui amènent les pollens.
Les pollens les plus présents dans l’atmosphère sont ceux des graminées, du chêne, du hêtre et du pin.